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呼吸内科前身-小儿呼吸系统疾病诊疗小组组建于1978年，2001年正式成立呼吸科。科室现有主任医师10人，副主任医师13人，主治医师17人;其中博士学位10人，硕士学位26人;博士生导师2人，硕士生导师5人，拥有床位100张，配备专业护理人员37名，主管护师9人，护理人员具有丰富的护理知识和扎实的护理技术。
科室对儿童呼吸道常见疾病及疑难杂症具有很高的诊治水平，2011年被评为国家临床重点专科，是浙江省及周边区域儿童呼吸系统疾病诊治中心，临床诊疗过程中努力遵循标准化、规范化的医疗行为规范，强调严谨循证、合理检查、合理用药，尤其是抗菌药物的合理应用、哮喘药物治疗的规范化与个体化选择，常规开展呼吸道感染患儿多种病原联合检测、过敏原检测、呼出气NO测定、皮肤点刺试验、免疫功能测定、肺功能测定及支气管镜检查与治疗、特异性免疫治疗等，年儿童支气管镜检查与治疗2000例以上。

临床诊疗过程中努力遵循标准化、规范化的医疗行为规范，强调严谨循证、合理检查、合理用药，尤其是抗菌药物的合理应用、哮喘药物治疗的规范化与个体化选择。同时不断学习与推广新知识与新技术，每年接受省内外呼吸科专科进修及儿童支气管镜技术培训医护人员近20名，目前已成为国内儿科呼吸与支气管镜专科技术进修学习的重要培训基地。

对儿童常见呼吸道疾病及呼吸道疑难杂症具有很高的诊治水平，是浙江省及周边区域儿童呼吸系统疾病诊治中心，半数以上住院患儿来自杭州市外及省外。常规开展呼吸道感染患儿多种病原联合检测、过敏原检测、皮肤点刺试验、免疫功能测定、肺功能测定及支气管镜检查与治疗、特异性免疫治疗等，年开展儿童支气管镜检查与治疗2000例以上。

本专科一直奉行临床科研并行发展、以科研促临床的发展思路。以浙江大学为依托，积极开展基础与临床研究，促进疾病诊断与治疗水平的提高。2008-2019年十年中共获14项国家自然科学基金资助(包括4项国家青年科学基金)，着重对儿童支气管哮喘发病机制及肺炎支原体感染的发病机制进行研究。同时还获得1项浙江省重大科技专项、5项浙江省自然科学基金资助。积极开展临床科研工作，参与了哮喘、慢性咳嗽、间质性肺部疾病等多项全国多中心研究，还参与了《国家抗微生物治疗指南》、《儿童支气管哮喘诊断与防治指南》(2008年和2016版)《儿童社区获得性肺炎管理指南(2019修订版)》、《儿童急性感染性鼻-鼻窦炎诊疗—临床实践指南》《儿童急性中耳炎诊疗—临床实践指南》等一系列指南的撰写。研究成果曾获得浙江省科学技术进步奖三等奖及浙江省医药卫生创新二等奖各2项。